Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms