Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAMP11215 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms