Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms