Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV1-8P0DP01 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms