Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms