Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MSMBP08118 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MSMBP08118 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSMBP08118 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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