Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL2A1P02458 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms