Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms