Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA4O75335 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms