Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD4O60885 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD4O60885 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD4O60885 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRD4O60885 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD4O60885 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD4O60885 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms