Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP104O60308 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP104O60308 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms