Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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