Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDIL3O43854 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDIL3O43854 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms