Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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