Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNMO15061 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNMO15061 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNMO15061 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNMO15061 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNMO15061 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNMO15061 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNMO15061 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms