Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BCKDKO14874 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BCKDKO14874 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms