Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms