Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COLCA2A8K830 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COLCA2A8K830 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COLCA2A8K830 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms