Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NL46 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
A6NL46 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NL46 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NL46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms