Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB19A4D1S5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms