Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AUP1Q9Y679 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AUP1Q9Y679 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms