Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGA4Q9Y5G9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA4Q9Y5G9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA4Q9Y5G9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA4Q9Y5G9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA4Q9Y5G9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA4Q9Y5G9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA4Q9Y5G9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA4Q9Y5G9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA4Q9Y5G9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms