Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HCN4Q9Y3Q4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HCN4Q9Y3Q4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HCN4Q9Y3Q4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms