Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDD3Q9Y3P4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD3Q9Y3P4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD3Q9Y3P4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms