Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRM2Q9UQ35 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM2Q9UQ35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM2Q9UQ35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms