Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
SHANK2Q9UPX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SHANK2Q9UPX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHANK2Q9UPX8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHANK2Q9UPX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHANK2Q9UPX8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHANK2Q9UPX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SHANK2Q9UPX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms