Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDZRN3Q9UPQ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PDZRN3Q9UPQ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDZRN3Q9UPQ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PDZRN3Q9UPQ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PDZRN3Q9UPQ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDZRN3Q9UPQ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDZRN3Q9UPQ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PDZRN3Q9UPQ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDZRN3Q9UPQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms