Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ALKQ9UM73 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ALKQ9UM73 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ALKQ9UM73 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
ALKQ9UM73 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ALKQ9UM73 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ALKQ9UM73 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ALKQ9UM73 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ALKQ9UM73 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ALKQ9UM73 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ALKQ9UM73 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ALKQ9UM73 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ALKQ9UM73 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms