Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP21Q9UK80 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP21Q9UK80 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
USP21Q9UK80 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
USP21Q9UK80 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP21Q9UK80 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms