Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD3Q9UJU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD3Q9UJU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD3Q9UJU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms