Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBD1Q9UJT1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBD1Q9UJT1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBD1Q9UJT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBD1Q9UJT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms