Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO40Q9UH90 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO40Q9UH90 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO40Q9UH90 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms