Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAJB4Q9UDY4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNAJB4Q9UDY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJB4Q9UDY4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJB4Q9UDY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms