Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPSF2Q9P2I0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPSF2Q9P2I0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms