Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNAJC28Q9NX36 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAJC28Q9NX36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJC28Q9NX36 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAJC28Q9NX36 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms