Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXD2Q9NVH0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXD2Q9NVH0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXD2Q9NVH0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXD2Q9NVH0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXD2Q9NVH0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXD2Q9NVH0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXD2Q9NVH0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms