Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED17Q9NVC6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MED17Q9NVC6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED17Q9NVC6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms