Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD18Q9NS91 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD18Q9NS91 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD18Q9NS91 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms