Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 54.6
DROSHAQ9NRR4 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 54.6
DROSHAQ9NRR4 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 511.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 54.6
DROSHAQ9NRR4 MIR194-2-201ENST00000384864 85 ntBASIC17.24■□□□□ 0.353e-38■■■■■ 54.4
DROSHAQ9NRR4 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 223.58■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 54.4
DROSHAQ9NRR4 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.628e-15■■■■■ 54.4
DROSHAQ9NRR4 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 321.45■■□□□ 1.023e-10■■■■■ 54.3
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-214ENST00000585881 582 ntTSL 34.78□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 54
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-220ENST00000530021 5233 ntTSL 215.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-217ENST00000527546 3358 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-210ENST00000525618 3982 ntTSL 211.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-221ENST00000530691 6307 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 MICAL2-209ENST00000525444 489 ntTSL 210.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 53.9
DROSHAQ9NRR4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 53.8
DROSHAQ9NRR4 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.741e-11■■■■■ 53.4
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.662e-7■■■■■ 53.4
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.442e-7■■■■■ 53.4
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 53.4
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 53.4
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-204ENST00000433070 698 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 53.4
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-207ENST00000458725 1657 ntTSL 217.42■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 53.4
DROSHAQ9NRR4 DGCR8-209ENST00000495826 4695 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.612e-25■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-25■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.961e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-212ENST00000588000 1542 ntTSL 233.55■■■□□ 2.961e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-218ENST00000588610 1087 ntTSL 1 (best)31.87■■■□□ 2.691e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.511e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-205ENST00000586195 1952 ntTSL 230.64■■■□□ 2.51e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-215ENST00000588308 2062 ntTSL 229.29■■■□□ 2.281e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-202ENST00000399594 2232 ntTSL 229.21■■■□□ 2.271e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.251e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-219ENST00000588889 967 ntTSL 526.8■■□□□ 1.881e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.321e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-207ENST00000586770 952 ntTSL 220.87■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-222ENST00000590043 482 ntTSL 518.92■□□□□ 0.621e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-231ENST00000593255 553 ntTSL 418.05■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 EML2-226ENST00000591721 526 ntTSL 316.16■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 53.2
DROSHAQ9NRR4 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 439.71■■■■□ 3.957e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.667e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CNIH4-208ENST00000477413 820 ntTSL 535■■■■□ 3.197e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-207ENST00000498554 929 ntTSL 534.85■■■■□ 3.177e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-204ENST00000478879 1925 ntTSL 234.41■■■■□ 3.17e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.097e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-206ENST00000497445 2144 ntTSL 234.27■■■■□ 3.087e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 UBE2G1-203ENST00000571980 984 ntTSL 533.62■■■□□ 2.977e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.937e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.837e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CASC4-204ENST00000557945 1386 ntTSL 1 (best)32.41■■■□□ 2.787e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 232.06■■■□□ 2.727e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.727e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 UBE2G1-206ENST00000574633 863 ntTSL 231.38■■■□□ 2.617e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-209ENST00000487617 819 ntTSL 331.27■■■□□ 2.67e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.597e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.547e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 LHPP-205ENST00000482963 1555 ntTSL 230.61■■■□□ 2.497e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.447e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.417e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC4-212ENST00000495497 849 ntTSL 529.68■■■□□ 2.347e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 529.65■■■□□ 2.347e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CASC4-203ENST00000429162 1918 ntTSL 229.46■■■□□ 2.317e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.277e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CASC4-209ENST00000559222 742 ntTSL 328.72■■■□□ 2.197e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 228.49■■■□□ 2.157e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 528.49■■■□□ 2.157e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CDC123-206ENST00000455773 959 ntTSL 528.33■■■□□ 2.137e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-210ENST00000589381 738 ntTSL 528.14■■■□□ 2.17e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 528.11■■■□□ 2.097e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CNIH4-206ENST00000468318 1525 ntTSL 227.82■■■□□ 2.047e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PLXNB2-205ENST00000432455 1620 ntTSL 527.33■■□□□ 1.977e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CDC123-203ENST00000429258 646 ntTSL 327.33■■□□□ 1.977e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-211ENST00000593185 462 ntTSL 227.32■■□□□ 1.967e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.947e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 527.12■■□□□ 1.937e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.847e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 LRRC14-203ENST00000527730 978 ntTSL 226.51■■□□□ 1.837e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-210ENST00000534080 1379 ntTSL 226.4■■□□□ 1.827e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.747e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.747e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.747e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.727e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.727e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 425.63■■□□□ 1.697e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 225.55■■□□□ 1.687e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-205ENST00000416156 1669 ntTSL 225.16■■□□□ 1.627e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.67e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-206ENST00000588300 1055 ntTSL 224.99■■□□□ 1.597e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.577e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 SERHL2-208ENST00000477564 2096 ntTSL 224.78■■□□□ 1.567e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 COL11A2-205ENST00000457788 2099 ntTSL 524.75■■□□□ 1.557e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.557e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 NELFA-212ENST00000463820 2495 ntTSL 224.09■■□□□ 1.457e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.437e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 CNIH4-204ENST00000366860 912 ntTSL 323.94■■□□□ 1.427e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.417e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 ERCC1-214ENST00000592083 938 ntTSL 523.69■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 52.8
DROSHAQ9NRR4 IZUMO4-212ENST00000610800 707 ntTSL 323.68■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 52.8
Retrieved 100 of 16,331 protein–RNA pairs in 238.4 ms