Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDHAF3Q9NRP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDHAF3Q9NRP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHAF3Q9NRP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms