Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM5Q9NQX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM5Q9NQX1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM5Q9NQX1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM5Q9NQX1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRDM5Q9NQX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM5Q9NQX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM5Q9NQX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms