Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PARD6AQ9NPB6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARD6AQ9NPB6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PARD6AQ9NPB6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6AQ9NPB6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6AQ9NPB6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms