Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNCQ9H7C4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNCQ9H7C4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNCQ9H7C4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNCQ9H7C4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms