Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIXL1Q9H2W2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIXL1Q9H2W2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MIXL1Q9H2W2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIXL1Q9H2W2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIXL1Q9H2W2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms