Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBN4Q9H254 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBN4Q9H254 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBN4Q9H254 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPTBN4Q9H254 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTBN4Q9H254 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms