Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NIF3L1Q9GZT8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NIF3L1Q9GZT8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NIF3L1Q9GZT8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIF3L1Q9GZT8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NIF3L1Q9GZT8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NIF3L1Q9GZT8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms