Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF518BQ9C0D4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF518BQ9C0D4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF518BQ9C0D4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF518BQ9C0D4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF518BQ9C0D4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF518BQ9C0D4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF518BQ9C0D4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF518BQ9C0D4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF518BQ9C0D4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms