Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRDL1Q9BU40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRDL1Q9BU40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRDL1Q9BU40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms