Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT3Q9BQG1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT3Q9BQG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT3Q9BQG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms