Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX5

ARPC5L, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5LQ9BPX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC5LQ9BPX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC5LQ9BPX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5LQ9BPX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5LQ9BPX5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5LQ9BPX5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms